氣調庫不僅在儲藏條件、庫房結構和設備配置等方面不同于普通果蔬菜冷厙，對運行管理方面也要嚴格得多。不單表現在儲藏階段，而且還涉及果蔬采后處理的全過程，運行管理的任一環節如果出現差錯，都會影響氣調儲藏的整體優勢和最終效果。運行管理工作的優劣直接關系到果蔬的儲藏質量，還關系到庫房建筑結構和人身安全。搞好氣調庫的運行管理，關鍵在于管理和操作人員的素質。氣調庫的管理人員必須具有良好的專業技術素質、高度的責任心及組織管理才干和從事經營的能力。

　　(1)適時采摘把握好果蔬的成熟度和最適采收期，對它的氣調儲藏至關重要。采摘過早，成熟度不夠，不僅影響食用品質，還會影響儲藏。這是由于過早采摘，果蔬內糖生成量較少，不耐儲藏；未成熟采后水分蒸發快，儲藏中失水多，而且果蔬體內抗病機制尚未健全，在儲藏中易發生生理病害。采摘過遲，果蔬已完全成熟，雖然其風味、質地和營養已達到較完美程度，食用性好，但它的生理代謝已進入后成熟期，內源乙烯被激發生成，內存的營養物質消耗加快，這些因素都降低了其耐儲性。同樣，它的抗病性也在下降，易在儲藏中發生病害。

　　果蔬的最佳采摘期，可以通過色澤、果形、口感、香味等感觀測定；硬度、重量、含水量等物理測定；含糖量、含酸量及淀粉含量等化學測定和觀察果蔬生長期內的氣象、施肥等方面的情況進行綜合評定。有條件的還可以測定果蔬的呼吸強度，作為成熟度的指標。采收時最好選擇陰天或晴天的上、下午。雨天、霧天、晴天有露水的早晚和氣溫高的中午都不宜采收。采收時要注意輕摘輕放，不能暴曬和雨淋。

　　(2)及時入庫先進行空庫降溫，果蔬經清洗、篩選、分裝后入庫。采用空庫降溫，可預先將圍護結構的蓄熱排除，加速果蔬田間熱的散發并盡快降低果蔬溫度及呼吸熱的產生。

　　在氣調問進行空庫降溫和入庫后的預冷降溫時，應注意保持庫內外的壓力平衡，不能封庫降溫，只能關門降溫。尤其是入庫后的降，一定要等果蔬溫度和庫溫達到并基本穩定在儲藏溫度時才能封庫，在降溫時就急于封庫，會在圍護結構兩側產生壓差，對結構安全造成威脅。當庫內溫度基本穩定后，應速封庫降氧，進行調氣作業。一般來講氣調間的降氧速度越快越好，考慮到在降氧的同時，也應使二氧化碳的濃度升到最佳值，而二氧化碳濃度的增加靠果蔬自身的呼吸，所以不必將庫內氧的濃度一下子降到最佳值，而應高出2～3個百分點，再利用果蔬的呼吸消耗掉這部分氧氣。

　　(3)合理有效的利用空間氣調庫的容積利用系數要比普通冷庫高，有人將其描述為“高裝滿堆”，這是氣調庫建筑設計和運行管理上的一個特點。所謂“高裝滿堆”是指裝入氣調庫的果蔬應具有較大的裝貨密度，除留出必要的通風和檢查通道外，盡量減少氣調庫的自由空間。因為，氣調庫內的自由空間越小，意味著庫內的氣體存量越少，這樣一方面可以適當減小氣調設備，另一方面可以加快氣調速度，縮短氣調時問，減少能耗，并使果蔬盡早進入氣調儲藏狀態。

　　(4)良好的空氣循環氣調庫在降溫過程中，循環速率范圍為：在果蔬入庫初期，換氣次數為30～50次／h，所以常選用雙速風機或多個軸流風機可以獨立控制的方案；在冷卻階段，風量大一些，冷卻速度快，當溫度下降到初值的一半或更小后，換氣次數控制在15～20次／h為宜。

　　(5)．快進整出氣調儲藏要求果蔬入庫速度快，盡快裝滿、封庫并及時調氣，讓果蔬在盡可能短的時間內進入氣調狀態。平時管理中也不能像普通冷庫那樣隨便進出貨物，否則庫內的氣體成分就會經常變動，從而減弱或失去氣調儲藏的作用。果蔬出庫時，最好一次出完或在短期內分出完。

　　(6)儲后的管理包括果蔬出庫、分級挑選包裝、發運，以及貨架期的質量監測。氣調間里的果蔬在出庫前一天應解除氣密狀態，停止氣調設備的運行，采取自然換氣的方法，使氣調間的氣體恢復到空氣成分，但仍要維持氣調間的溫濕度，操作人員才能入庫作業。由于果蔬入庫時時間都比較緊迫，來不及仔細挑選分級，出庫時則必須嚴格地挑選分級，將各種傷殘病次栗挑出，分級包裝發運。果蔬出庫后，應隨機取樣進行貨架期的觀察和監測。質量監測要在比較穩定的溫濕度下進行，這樣才能排除外界因素的影響，在同等條件下比較出不同儲藏期和不同品種之問貨架期的差別。沒有恒溫恒濕條件，在常溫下也可以做，但可比性較差。

　　(7)氣調庫及設備的年檢大修氣調庫及設備經一個儲季后(一般都在半年以上)，必須進行年檢大修，管理人員應制定出詳細的檢修計劃。氣密破損的部位在修復后應重新進行氣密性試驗。各種機器設備、管道閥門、控制儀器儀表、電氣部件等均應按說明書的要求進行年檢大修。經試運轉后，應恢復到原有的性能，為下一儲季做好準備。